Neue Plattform ASHOP ermöglicht integrative Analyse genomischer und klinischer Daten bei Blutkrebs
Die American Society of Hematology (ASH) hat eine neue open-access Plattform namens ASH HematOmics Program (ASHOP) gestartet, die genomische, transkriptomische und klinische Daten von fast 6.000 Patienten mit hämatologischen Erkrankungen zentral zugänglich macht und interaktiv analysierbar. Die Plattform enthält Daten zu somatischen Mutationen, Genfusionen, Genexpressionsprofilen und klinischen Verläufen von Patienten mit B-Zell-Vorläufer- und T-Zell-akuter lymphatischer Leukämie (ALL), akuter myeloischer Leukämie (AML), myelodysplastischen Syndromen (MDS) und chronischer lymphatischer Leukämie (CLL). ASHOP ermöglicht Nutzern, Landschaften genomischer Veränderungen und Co-Mutationsmuster über Lollipop- und Matrix-Plots zu visualisieren, signifikant veränderte Gene in selbstdefinierten Subkohorten zu analysieren sowie Transkriptom-Daten mit interaktiven UMAPs, Clustering, differentieller Expression und Pathway-Enrichment zu erkunden. Genomische und transkriptomische Merkmale lassen sich frei mit klinischen Outcomes korrelieren. In vier Anwendungsbeispielen demonstrieren die Autoren den Nutzen der Plattform: Die Plattform (ashop.hematology.org) soll Forschern helfen, die komplexen molekularen Treiber hämatologischer Erkrankungen besser zu verstehen und…
